Цитата: 1. Нет,вид транспорта не упоминается и возможность замены так же не прописана. 2. Прежде таких вопросов не было.
Тогда ситуация неоднозначная, не урегулированная нормативными актами.
Цитата: 3. Аргументирует тем,что самолетом быстрее чем поездом.
Если бы у него возникли особые личные или семейные обстоятельства, можно было бы счесть это важным фактором. Учтите на будущее, чтобы тщательно прописать в ЛНА и такие случаи.
Цитата: 4. Билет не сдан,деньги пропали. Мы не знали что он не поехал поездом,узнали только после того как он улетел самолетом
Если вы категорически не хотите проблем и судов с работником, можно возместить ему стоимость авиаперелёта (в порядке исключения, одновременно внеся необходимые дополнения в Положение о работе вахтовым методом и ознакомив с ними работников).
И предъявить к удержанию затраты, понесённые работодателем в связи с приобретением ему билета на поезд (ст. 238 ТК РФ).
И может ещё объявить дисциплинарное взыскание, если у вас в ЛНА прописано, что от вахтового посёлка до пункта сбора вся бригада должна добираться строго вместе. Или что работник обязан заблаговременно предупредить работодателя об изменении вида транспорта или даты выезда. Или что-то ещё подобное.